马大是许多国际组织的成员，例如：欧洲大学协会（EUA）[www.cua.be]、英联邦大学协会[www.acu.ac.uk]、欧洲国际联网协会（EAN）[www.ean.edu.org]、桑坦德组织[www.sgroup.be]、康跑斯泰勒大学组织[www.groupcompostela.org]、国际学生交换项目（ISEP）[www.isep.org]、欧盟－地中海大学论坛[www.epuf.org]

此外，马大各院系和中心与世界许多大学和研究机构，特别是英国、美国和意大利的大学保持着良好的研究和合作关系。

马大校园内有几个国际组织，包括：国际海洋法学会(IMLI)[www.imli.org]、国际海洋学院马耳他运行中心[www.ioinst..org]、地中海外交研究学院。

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